ARISE

Infrastructuur en gebruikersdiensten 

ARISE is de Nederlandse infrastructuur voor de identificatie van soorten met behulp van innovatieve technologieën, waaronder beeldherkenning, geluidsherkenning, DNA-barcoding en radar. We ontwikkelen referentiebibliotheken voor alle Nederlandse soorten, zodat onbekende DNA-sequenties, beelden en geluiden kunnen worden geïdentificeerd op basis van bestaande kennis. ARISE vormt daarmee de basis voor het monitoren van soorten op het land, in het water, in de bodem en in de lucht. Concreet verzamelen we DNA-barcodes voor alle Nederlandse soorten, die worden opgeslagen in en gekoppeld aan bestaande databases zoals BOLD en Unite. Elke gebruiker heeft toegang tot deze databases. Voor beeld en geluid hebben we pijplijnen ontwikkeld waar gebruikers hun beeld- en geluidsbestanden kunnen indienen, het AI-algoritme kunnen kiezen om soorten te identificeren en bestanden met gevalideerde soortinformatie kunnen opslaan. Bovendien staan onze laboratoria ter beschikking voor analyses van DNA-monsters met het oog op soortidentificatie. Ons sensorportaal kan een reeks sensortypen (bijv. camera's, microfoons) koppelen aan onze op AI gebaseerde analysepijplijnen, terwijl onze biocloud de opslag en het beheer van gegevens kan vergemakkelijken. Ten slotte zijn gegevens van sensoren op onze demonstratielocaties beschikbaar voor gebruik door onderzoekers via bekende repositories zoals GBIF en Zenodo.

Voorbeelden/beschrijving van het type onderzoek

Biodiversiteitsmonitoring is momenteel beperkt tot enkele groepen grote soorten (bijv. vogels, zoogdieren), terwijl het grootste deel van de biodiversiteit niet wordt gemonitord. ARISE-tools en -pijplijnen maken het mogelijk om: (1) de soortendiversiteit en -omzet in de Nederlandse habitats te beoordelen; (2) het voedingspatroon en de verspreidingspatronen van soorten te beoordelen met behulp van onze sensoren en bemonstering; en (3) te dienen als een vroegtijdige waarschuwing voor nieuw aangekomen soorten en als detector van de gevolgen van o.a. klimaatverandering.

Toegang tot de infrastructuur 

Voor identificatie op basis van DNA: gebruikers kunnen monsters indienen voor de ARISE-soortenreferentiedatabase of DNA-analyses door middel van gestandaardiseerd bemonsteringsmateriaal, toegang tot gegevensregistratie en interfaces om resultaten te bekijken. Voor beeld- en geluidsherkenningsdiensten: sensoren kunnen direct worden geregistreerd of gegevens kunnen worden geüpload via registratie, waarna het online analyseplatform (interface) kan worden gebruikt.