NL-BI
NL-Biolmaging-AM: Een geavanceerde multicenter microscopie-infrastructuur voor Nederland
Recente ontwikkelingen op het gebied van microscopie hebben het vermogen om processen in cellen, organoïden en kleine diermodellen te identificeren en te manipuleren sterk verbeterd. NL-BioImaging (NL-BI) zal state-of-the-art microscopietechnologieën en -diensten ontwikkelen en integreren om alle Nederlandse wetenschappers toegang te geven tot revolutionaire fundamentele inzichten in de bouwstenen van het leven, wetenschappelijke doorbraken mogelijk te maken en toepassingen voor de samenleving te bevorderen om levensbedreigende ziekten, waaronder kanker, hart- en vaatziekten en neurodegeneratieve aandoeningen, te overwinnen. NL-BI, dat is ingebed in de Europese infrastructuur Euro-BioImaging en samenwerkt met de Nederlandse Vereniging voor Microscopie en de Netherlands EM Infrastructure (NEMI), speelt een sleutelrol bij het veiligstellen van de leidende positie van Nederland op het gebied van microscopie.
Infrastructuur en gebruikersdiensten
NL-BI ontwikkelt en verbindt state-of-the-art technologieën en diensten voor functionele beeldvorming van levende processen om fenotypische heterogeniteit, reacties en mechanismen te onderzoeken. NL-BI stelt de Nederlandse onderzoeksgemeenschap in staat om:
- Nieuwe moleculaire sondes en biosensoren te gebruiken voor functionele beeldvorming;
- Snelle 3D-beeldvormingstechnologieën toe te passen voor functionele beeldvorming in complexe levende celsystemen;
- High-content microscopiescreens uit te voeren voor veranderingen in het celfenotype;
- Schaalovergangen te overbruggen naar elektronenmicroscopie en intravitale microscopie;
- Complexe microscopieworkflows en on-the-fly data-analyse te automatiseren om de experimentele doorvoer enorm te verhogen en onbevooroordeelde, onderzoeker-onafhankelijke output te leveren;
- Gebruik te maken van een nationaal netwerk voor FAIR-beeldgegevensbeheer dat infrastructuur, training en gebruiksvriendelijke workflows biedt voor data-analyse van biologische beelden door geavanceerde neurale netwerken;
- Een landelijk opleidings- en outreachplatform opzetten voor wetenschappers van alle niveaus.
Door gecoördineerde toegang te bieden tot de beste beeldtechnologie en analyseplatforms van Nederland, zal het NL-BI-roadmapvoorstel de broodnodige excellentie in geavanceerde optische microscopie bereiken om het internationale concurrentievermogen van het Nederlandse life science-onderzoek veilig te stellen. Deze knooppunten zullen ook de noodzakelijke fundamenten leggen om microscopie te integreren met de omics-technologieën ('visuele omics').
Voorbeelden/beschrijving van het type onderzoek
NL-BI zal zich richten op geavanceerde (licht)microscopietechnologieën die nieuw inzicht verschaffen in de moleculaire werking van cellen in hun relevante dynamische context. Dit mechanistische inzicht en een beter begrip van het leven zullen ons uiteindelijk in staat stellen om diagnoses te verbeteren, innovatieve gepersonaliseerde therapieën van de volgende generatie te ontwikkelen en de juiste sociaaleconomische keuzes te maken bij uitdagingen op het gebied van duurzame landbouw. Om deze doelstellingen te bereiken, zal NL-BI state-of-the-art technologieën voor functionele beeldvorming van processen in levende cellen, weefsels in vitro en levende dieren met high-content microscopie ontwikkelen, integreren en koppelen. Dit zal het mogelijk maken om niet alleen de moleculaire mechanismen te ontrafelen die de juiste celfunctie regelen en reguleren, maar ook de fenotypische reacties en mechanismen die de cellulaire processen onderliggend aan de menselijke pathologie verklaren of beïnvloeden. Op deze manier stelt NL-BI een breed scala aan levenswetenschappers in Nederland en daarbuiten in staat om baanbrekende ontdekkingen te doen.
Toegang tot de infrastructuur
Voornamelijk fysieke toegang tot instrumenten (via de verschillende toegangsroutes zoals beschreven in het document Toegangsbeleid), waaronder 1) toegang via de lokale kernfaciliteit, 2) toegang via de NL-BI-website en 3) toegang via EuoBioImaging, evenals toegang tot gegevensbestanden en programma's voor gegevensanalyse.