NIMP
Nationaal Immuunmonitoring Platform
Het Nationaal Immuunmonitoringplatform (NIMP) is een netwerk van onderzoeksinstellingen verspreid over Nederland die hun unieke expertise op verschillende gebieden van de analyse van het immuunsysteem bundelen om een geïntegreerd instrument te bieden dat een revolutie teweeg zal brengen in immuunmonitoring en precisiegeneeskunde mogelijk zal maken voor immuungemedieerde ontstekingsziekten en kanker. Daarnaast wil NIMP ondersteuning bieden bij de ontwikkeling van immuungerichte geneesmiddelen, de verbetering van orgaantransplantaties en vaccinatiestrategieën.
Infrastructuur en gebruikersdiensten
NIMP is ontworpen als een multicenterplatform dat de volgende experts op het gebied van verschillende aspecten van het immuunsysteem samenbrengt:
- Cytomics Node (Amsterdam UMC/Radboud Universiteit Nijmegen): functionele testen van immuunactiviteit, karakterisering van immuunsubgroepen in bloed en weefsels (multiplex immunofenotypering en single-cell transcriptomics) en ontwikkeling van een nieuwe modaliteit voor celanalyse, time-lapse cytometrie.
- Proteomics Node (Amsterdam UMC/Erasmus MC): analyse van het volledige en gerichte plasma-proteoom, single-cell proteomics en fosfoproteomics van immuuncellen.
- Immunometabolism Node (LACDR): focus op analyse van het volledige metabolisme in plasma en andere relevante weefsels, evenals de ontwikkeling van single-cell metabolomics.
- Microbiome Node (Amsterdam Microbiome Expertise Center): karakterisering van het darmmicrobioom in verband met immunologische functie.
- Antibody Diversity Node (Sanquin Research/LUMC): antilichaamdiversiteit en -functionaliteit, BCR/TCR-sequencing (B/T-celrepertoireanalyses) en antilichaamglycosylatie.
- Data-integratieknooppunt (Amsterdam UMC/SILS): Onderzoeksgegevensbeheer, computationele analyse, data-integratie, longitudinale statistische analyse.
- Onderzoeksontwerpknooppunt (Amsterdam UMC): Ondersteuning bij het ontwerpen van klinische studies met betrekking tot immuunmonitoring.
- Outreach-knooppunt (ImmuneHealth XL): Betrokkenheid van patiënten, interactie met onderzoeksstichtingen, beleidsadvies.
NIMP biedt diensten op verschillende niveaus:
- Volledige immuunmonitoringdiensten: we bieden ondersteuning bij onder meer studieontwerp, monsterafname en biobanking, monsterverwerking, gegevensverzameling, gegevensbeheer en -analyse, en gegevensinterpretatie.
- Gerichte immuunmonitoringdiensten. Voor specifieke projecten kunnen we het dienstenaanbod aanpassen aan de behoeften van de gebruikers (door analytische opties weg te laten).
Voorbeelden/beschrijving van het soort onderzoek
Het immuunsysteem is buitengewoon complex vanwege de enorme dynamische diversiteit aan cel(sub)types die via een groot aantal chemische mediatoren met elkaar interageren. Bovendien verandert het immuunsysteem voortdurend als reactie op externe (microbioom, levensstijl, omgeving) en interne factoren (genetica, neurale, endocriene en metabolische factoren). Om immuunmonitoring naar een hoger niveau te tillen, is een alomvattende benadering van het immuunsysteem noodzakelijk, maar daarvoor zijn aanzienlijke expertise en technologische uitmuntendheid vereist. Chronische immuungemedieerde ontstekingsziekten (IMID's) vertegenwoordigen >80 steeds vaker voorkomende aandoeningen die 5-7% van de mensen treffen. Bovendien speelt het immuunsysteem een cruciale rol bij allergieën, infectieziekten, kanker, hart- en vaatziekten en metabool syndroom, die samen >60% van de mensen in ontwikkelde landen treffen. Kleine geneesmiddelen, immuunmodulerende biologische geneesmiddelen (immunotherapieën) en vaccins bieden nieuwe therapeutische mogelijkheden voor deze ziekten. Een belangrijke beperking voor een succesvolle toepassing ervan is echter het ontbreken van geschikte begeleidende diagnostiek in een vroeg stadium om (1) de efficiëntie te voorspellen, (2) responsieve patiënten te identificeren en (3) immuungerelateerde bijwerkingen te voorkomen. Het oplossen van deze problemen is noodzakelijk voor IMID's, waarvoor meerdere immuuntherapieën bestaan en patiënten over het algemeen een cyclus van zes maanden van 'trial and error' doorlopen om een klinische respons te bereiken. Dit geldt ook voor kankerpatiënten die worden behandeld met checkpointremmers of andere soorten immuuntherapie, en zou een enorme impact hebben op het rationeel ontwerpen van vaccins tegen allergenen, opkomende virussen en multiresistente bacteriën. Belangrijk is dat ontwikkelingen in single-cell-technologieën en omics een ongekend inzicht in ons immuunsysteem bieden. We kunnen nu systeemimmunologie en AI-gestuurde methodologieën gebruiken om cytomics, proteomics, metabolomics en microbiomics te integreren in meerlaagse immunotypes die kunnen worden gekoppeld aan klinische resultaten.
Hoe krijgt u toegang tot de infrastructuur?
- Intern: gebruikers van hetzelfde academische centrum, rechtstreeks via lokale node (ongeveer 35%)
- Extern academisch: gebruikers van andere academische onderzoeksinstellingen, via aanvraag bij programmamanager (ongeveer 30%).
- Extern niet-academisch: gebruikers van klinische onderzoeksorganisaties en de farmaceutische industrie, via business developer (ongeveer 30%).