AMICE

Infrastructuur en gebruikersdiensten

AMICE is een Nederlandse infrastructuur met meerdere locaties waaraan alle Nederlandse experimentele en preklinische beeldvormingscentra deelnemen. Het LSRI wordt ondersteund door onderzoeksgroepen van technische universiteiten, datawetenschap en statistiek (CWI en LUMC) en gespecialiseerde onderzoeksfaciliteiten zoals BPRC (Rijswijk) en BSL3-faciliteit (Erasmus MC), die aanvullende expertise bieden op het gebied van de ontwikkeling van nieuwe technologie, datawetenschap en statistische innovatie, en ziektemodellen. De partners van het AMICE-consortium bieden elk een lokale infrastructuur waar veelgebruikte of minder draagbare apparatuur (bijv. MRI- en PET/SPECT-scanners) en algemene expertise op het gebied van beeldvormingswetenschap zich op alle of geografisch verspreide locaties bevinden om het gebruiksgemak te waarborgen. 

Zeer gespecialiseerde apparatuur wordt/zal worden geplaatst op gespecialiseerde locaties waar technische en toepassingsdeskundigheid op dat gebied aanwezig is, bijv. ultrahoge veld-MRI en nieuw ontwikkelde geavanceerde (hybride) beeldvormingssystemen. Op deze manier kan beeldvorming op alle locaties op hoog niveau plaatsvinden, terwijl gespecialiseerde apparatuur en expertise voor alle gebruikers toegankelijk is via de nationale infrastructuur. AMICE streeft naar het creëren van een centraal gecoördineerde FAIR-gegevensopslagplaats, om het delen en hergebruiken van gegevens mogelijk te maken en zo de robuustheid van nieuwe experimenten te verbeteren. 

Om de wetenschappelijke robuustheid verder te vergroten, streeft AMICE ook naar het creëren van gecentraliseerde pijplijnen voor gegevensanalyse en statistische toolboxen, inclusief ondersteuning door experts. Belangrijk is dat AMICE ook zal fungeren als een opleidings- en expertisecentrum, dat aanbevelingen doet voor beste praktijken voor onderzoek en commerciële toepassingen van bestaande en nieuwe technieken, terwijl de 3R's en Open Science worden geïmplementeerd.     

Voorbeelden/beschrijving van het soort onderzoek  

 AMICE biedt als preklinische/experimentele beeldvormingsinfrastructuur een platform voor de ontwikkeling, evaluatie en toepassing van hoogwaardige, multimodale beeldvormingstechnologie voor onderzoek binnen de levenswetenschappen, geneesmiddelenontwikkeling en in beperkte mate ook in de materiaalkunde. Het stelt onderzoekers in staat om in levend materiaal te kijken en te observeren hoe individuele aspecten (moleculen, cellen, organellen, organen) functioneren en op elkaar inwerken in hun natuurlijke habitat: de complexe omgeving van een levend organisme. Daarnaast zal AMICE een gecentraliseerde en gemakkelijk toegankelijke FAIR-gegevensopslagplaats en beeldanalysetoolbox bieden om het delen van gegevens, hergebruik van gegevens en consistente en robuuste gegevensanalyse mogelijk te maken. Deze aspecten zullen de informatieve waarde van beeldgegevens vergroten. 

Een belangrijk toepassingsgebied van AMICE omvat alle biomedische onderzoeksonderwerpen waarbij het onderzoek gericht is op het ophelderen van biologische processen tijdens normale ontwikkeling, ziekte en/of reactie op behandeling. Dit omvat onderzoek naar hoe geneesmiddelen zich in het lichaam gedragen en hoe ze hun werking uitoefenen. De belangrijkste toepassingsgebieden waarvoor AMICE momenteel infrastructuur en expertise biedt, zijn: neurowetenschappen, cardiovasculaire wetenschappen, oncologie en regeneratieve geneeskunde.  

Hoe krijgt u toegang tot de infrastructuur?  

• Fysieke toegang: gebruik van beeldvormingssystemen; deskundig advies; opleiding en onderwijs
• Virtuele (digitale) toegang: open access-gegevensinfrastructuur; toolbox voor gegevensanalyse
• Toegang op afstand: deskundig advies; opleiding en onderwijs